新建松江南站枢纽总规模为9台23线。沪苏湖高铁场4台9线（2场共用站台一座），普速场4台10线（2场共用站台一座），含正线两条，货物到发线两条；既有沪杭高铁2台4线；预留东西联络线、沪杭城际等规划线路。
站房主体5层，其中地上4层:广场层（-10450m-9.750）、站台层（±0.000m）、高架层（9.900m）、旅客服务夹层（17.900m）；地下1层（-17.250m）。东西两侧设置无站台柱钢结构雨棚。建筑造型以“云间映玉兰,花开无限环”为设计理念。国铁站房部分自然形成“无限环”形象的核心,并在北侧以圆弧的体量
,较好地融合了松江南站站场与城市轴线的关系,在北立面形成了完整、开放的城市空间。